PubMed Central

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PubMed Central
ProduzentUnited States National Library of Medicine (Vereinigte Staaten)
Geschichte2000 bis heute
Zugriff
KostenKostenlos
Abdeckung
DisziplinenMedizin
AufzeichnungstiefeIndex, Abstract & Volltext
FormatabdeckungZeitungsartikel
Links
Webseitehttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/
Titelliste (n)https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/journals/

PubMed Central ( PMC ) ist ein kostenloses digitales Repository , das Open-Access -Volltext-Artikel archiviert , die in biomedizinischen und Life-Science- Fachzeitschriften veröffentlicht wurden. Als eine der wichtigsten Forschungsdatenbanken, die vom Nationalen Zentrum für Biotechnologie-Informationen (NCBI) entwickelt wurden, ist PubMed Central mehr als ein Dokumenten-Repository. Übermittlungen an PMC werden indiziert und für erweiterte Metadaten , medizinische Ontologie und eindeutige Kennungen formatiert , die die strukturierten XML- Daten für jeden Artikel bereichern . [1] Inhalte innerhalb von PMC können mit anderen NCBI-Datenbanken verknüpft und über abgerufen werdenEntrez- Such- und Abrufsysteme verbessern die Fähigkeit der Öffentlichkeit, ihr biomedizinisches Wissen zu entdecken, zu lesen und darauf aufzubauen. [2]

PubMed Central unterscheidet sich von PubMed . [3] PubMed Central ist ein kostenloses digitales Archiv mit vollständigen Artikeln, auf das jeder von überall über einen Webbrowser zugreifen kann (mit unterschiedlichen Bestimmungen für die Wiederverwendung). Obwohl PubMed eine durchsuchbare Datenbank mit biomedizinischen Zitaten und Abstracts ist, befindet sich der Volltextartikel an anderer Stelle (in gedruckter oder Online-Form, kostenlos oder hinter einer Paywall für Abonnenten ).

Bis Dezember 2018 enthielt das PMC-Archiv über 5,2 Millionen Artikel [4], wobei Beiträge von Verlegern oder Autoren stammten, die ihre Manuskripte gemäß der NIH Public Access Policy im Repository hinterlegten . Frühere Daten zeigen, dass von Januar 2013 bis Januar 2014 von Autoren initiierte Einzahlungen innerhalb eines Zeitraums von 12 Monaten 103.000 Papiere überstiegen. [5] PMC identifiziert ungefähr 4.000 Zeitschriften, die in gewisser Weise daran beteiligt sind, ihre veröffentlichten Inhalte im PMC-Repository abzulegen. [6]Einige Verlage verzögern die Veröffentlichung ihrer Artikel auf PubMed Central um eine festgelegte Zeit nach der Veröffentlichung, die als "Sperrfrist" bezeichnet wird und je nach Zeitschrift zwischen einigen Monaten und einigen Jahren liegt. (Embargos von sechs bis zwölf Monaten sind am häufigsten.) PubMed Central ist ein Schlüsselbeispiel für eine "systematische externe Verteilung durch Dritte" [7], die nach den Mitwirkungsvereinbarungen vieler Verlage immer noch verboten ist.

Annahme [ Bearbeiten ]

Das im Februar 2000 gestartete Repository ist rasant gewachsen, da mit der NIH-Richtlinie für den öffentlichen Zugang alle von den National Institutes of Health (NIH) finanzierten Forschungsarbeiten für jedermann frei zugänglich gemacht werden sollen. Darüber hinaus arbeiten viele Verlage mit dem NIH zusammen freien Zugang zu ihren Werken zu gewähren. Ende 2007 wurde das Consolidated Appropriations Act von 2008 (HR 2764) in das Gesetz aufgenommen und enthielt eine Bestimmung, nach der das NIH seine Richtlinien ändern und vollständige elektronische Kopien seiner von Experten geprüften Forschungsergebnisse und Ergebnisse aus NIH-Mitteln in PubMed Central aufnehmen muss Forschung. Diese Artikel müssen innerhalb von 12 Monaten nach Veröffentlichung enthalten sein. Dies ist das erste Mal, dass die US-Regierung von einer Behörde verlangt, Open Access bereitzustellenzu forschen und ist eine Weiterentwicklung der Politik von 2005, in der das NIH Forscher aufforderte, ihre Forschung freiwillig zu PubMed Central hinzuzufügen. [8]

Eine britische Version des PubMed Central-Systems, UK PubMed Central (UKPMC) , wurde vom Wellcome Trust und der British Library als Teil einer neunköpfigen Gruppe britischer Forschungsförderer entwickelt. Dieses System wurde im Januar 2007 in Betrieb genommen. Am 1. November 2012 wurde es zu Europe PubMed Central . Das kanadische Mitglied des PubMed Central International-Netzwerks, PubMed Central Canada , wurde im Oktober 2009 gegründet.

Die Markup-Sprache für Zeitschriftenartikel der Nationalbibliothek für Medizin "NLM Journal Publishing Tag Set" ist frei verfügbar. [9] Die Association of Learned and Professional Society Publishers kommentiert: "Es wird wahrscheinlich zum Standard für die Erstellung wissenschaftlicher Inhalte für Bücher und Zeitschriften." [10] Für Bücher steht eine zugehörige DTD zur Verfügung. [11] Die Library of Congress und die British Library haben die Unterstützung der NLM-DTD angekündigt. [12] Es war auch bei Journaldienstleistern beliebt. [13]

Mit der Veröffentlichung von Plänen für den öffentlichen Zugang für viele Agenturen außerhalb von NIH ist PMC dabei, das Repository für eine größere Vielfalt von Artikeln zu werden. [14] Dies schließt NASA-Inhalte mit der als "PubSpace" gekennzeichneten Oberfläche ein. [15] [16]

Technologie [ bearbeiten ]

Artikel werden von Herausgebern in XML oder SGML unter Verwendung einer Vielzahl von Artikel- DTDs an PubMed Central gesendet . Ältere und größere Verlage verfügen möglicherweise über eigene DTDs, aber viele Verlage verwenden die NLD Journal Publishing DTD (siehe oben).

Empfangene Artikel werden über XSLT in die sehr ähnliche NLM-Archivierungs- und Austausch-DTD konvertiert . Dieser Vorgang kann Fehler aufdecken, die dem Herausgeber zur Korrektur gemeldet werden. Grafiken werden auch in Standardformate und -größen konvertiert. Die ursprünglichen und konvertierten Formulare werden archiviert. Das konvertierte Formular wird zusammen mit den zugehörigen Dateien für Grafiken, Multimedia oder andere zugehörige Daten in eine relationale Datenbank verschoben. Viele Verlage stellen auch PDFs ihrer Artikel zur Verfügung, die unverändert zur Verfügung gestellt werden. [17]

Bibliografische Zitate werden analysiert und automatisch mit den relevanten Abstracts in PubMed, Artikeln in PubMed Central und Ressourcen auf den Websites der Herausgeber verknüpft. PubMed-Links führen auch zu PubMed Central. Nicht auflösbare Verweise, z. B. auf Zeitschriften oder bestimmte Artikel, die in einer dieser Quellen noch nicht verfügbar sind, werden in der Datenbank nachverfolgt und automatisch "live" geschaltet, sobald die Ressourcen verfügbar werden.

Ein internes Indexierungssystem bietet Suchfunktionen und kennt biologische und medizinische Begriffe wie generische oder proprietäre Medikamentennamen sowie alternative Namen für Organismen, Krankheiten und anatomische Teile.

Wenn ein Benutzer auf eine Zeitschriftenausgabe zugreift, wird automatisch ein Inhaltsverzeichnis erstellt, indem alle Artikel, Briefe, Leitartikel usw. für diese Ausgabe abgerufen werden. Wenn ein tatsächliches Element wie ein Artikel erreicht ist, konvertiert PubMed Central das NLM-Markup zur Zustellung in HTML und stellt Links zu verwandten Datenobjekten bereit. Dies ist möglich, da die Vielzahl der eingehenden Daten zunächst in Standard-DTDs und Grafikformate konvertiert wurde.

In einem separaten Einreichungsstrom können NIH-finanzierte Autoren Artikel mithilfe der NIH Manuscript Submission (NIHMS) in PubMed Central hinterlegen. Auf diese Weise eingereichte Artikel durchlaufen normalerweise ein XML-Markup, um in eine NLM-DTD konvertiert zu werden.

Empfang [ Bearbeiten ]

Die Reaktionen der wissenschaftlichen Verlagsgemeinschaft auf PubMed Central reichen von einer echten Begeisterung einiger [18] bis zu einer vorsichtigen Besorgnis anderer. [19]

Während PMC ein willkommener Partner für Open-Access-Verlage ist, um die Entdeckung und Verbreitung von biomedizinischem Wissen zu fördern, macht diese Wahrheit anderen Sorgen, dass der Verkehr von der veröffentlichten Version der Aufzeichnung abgelenkt wird , was auch die wirtschaftlichen Folgen einer geringeren Leserschaft betrifft als die Auswirkung auf die Aufrechterhaltung einer Gemeinschaft von Gelehrten in gelehrten Gesellschaften. [20] [21] Eine Analyse aus dem Jahr 2013 ergab starke Beweise dafür, dass öffentliche Repositories veröffentlichter Artikel dafür verantwortlich waren, "eine erhebliche Anzahl von Lesern von Zeitschriftenwebsites wegzuziehen" und dass "die Wirkung von PMC mit der Zeit zunimmt". [22]

Bibliotheken, Universitäten, Open-Access-Unterstützer, Interessengruppen für Verbrauchergesundheit und Patientenrechtsorganisationen haben PubMed Central begrüßt und hoffen, dass ähnliche Repositories für den öffentlichen Zugang von anderen Bundesfinanzierungsagenturen entwickelt werden, um Forschungspublikationen, die das Ergebnis der Unterstützung der Steuerzahler waren, frei zu teilen . [23]

Die Antelman-Studie zum Open-Access-Verlagswesen ergab, dass Open-Access- Papiere in den Bereichen Philosophie, Politikwissenschaft, Elektrotechnik und Elektronik sowie Mathematik einen größeren Einfluss auf die Forschung hatten. [24] Eine randomisierte Studie ergab eine Zunahme der Inhaltsdownloads von Open-Access-Papieren, ohne dass ein Jahr nach Veröffentlichung ein Zitiervorteil gegenüber dem Abonnementzugriff besteht. [25]

Die NIH-Politik und die Open-Access-Repository-Arbeit haben eine Präsidialrichtlinie von 2013 inspiriert, die auch in anderen Bundesbehörden Maßnahmen ausgelöst hat.

Im März 2020 beschleunigte PubMed Central seine Hinterlegungsverfahren für den vollständigen Text von Veröffentlichungen zum Thema Coronavirus . Das NLM tat dies auf Anfrage des Büros für Wissenschafts- und Technologiepolitik des Weißen Hauses und internationaler Wissenschaftler, um den Zugang für Wissenschaftler, Gesundheitsdienstleister, Data-Mining-Innovatoren , KI-Gesundheitsforscher und die breite Öffentlichkeit zu verbessern . [26]

PMCID [ bearbeiten ]

Die PMCID (PubMed Central-Kennung), auch als PMC-Referenznummer bezeichnet, ist eine bibliografische Kennung für die PubMed Central-Datenbank, ähnlich wie die PMID die bibliografische Kennung für die PubMed- Datenbank. Die beiden Bezeichner sind jedoch unterschiedlich. Es besteht aus "PMC", gefolgt von einer Folge von sieben Zahlen. Das Format ist: [27]

  • PMCID: PMC1852221

Autoren, die sich für NIH- Preise bewerben, müssen die PMCID in ihre Bewerbung aufnehmen.

Siehe auch [ Bearbeiten ]

  • Europa PubMed Central
  • JATS (Technologie)
  • MEDLINE , eine internationale Literaturdatenbank für Biowissenschaften und biomedizinische Informationen
  • PMID (PubMed Identifier)
  • PubMed Central Canada
  • Redalyc (ähnliches Projekt mit Schwerpunkt Lateinamerika)
  • SciELO (ähnlicher Service)

Referenzen [ bearbeiten ]

  1. ^ Beck J (2010). "Bericht aus der Praxis: PubMed Central, ein XML-basiertes Archiv der Zeitschriftenartikel des Life Sciences". Vorträge des Internationalen Symposiums zu XML auf lange Sicht: Fragen der langfristigen Erhaltung von XML . 6 . doi : 10.4242 / BalisageVol6.Beck01 . ISBN 978-1-935958-02-4.
  2. ^ Maloney C., Sequeira E., Kelly C., Orris R., Beck J. (5. Dezember 2013). PubMed Central . Nationales Zentrum für Biotechnologie-Informationen (USA).
  3. ^ "MEDLINE, PubMed und PMC (PubMed Central): Wie unterscheiden sie sich?" . www.nlm.nih.gov . 9. September 2019.
  4. ^ "Offenheit durch Standard", Inside Higher Ed , 16. Januar 2017.
  5. ^ "NIHMS-Statistik" . nihms.nih.gov .
  6. ^ "Home - PMC - NCBI" . www.ncbi.nlm.nih.gov .
  7. ^ Ouerfelli N. "Autorenrechte: Worum geht es ? " (PDF) .
  8. ^ "Öffentlicher Zugang zu NIH-Forschung machte Recht" . Wissenschaftskodex . 2007. Archiviert vom Original am 4. März 2016 . Abgerufen am 6. November 2013 .
  9. ^ "Journal Publishing Tag Set" . Nationales Zentrum für Informationen zur Biotechnologie . Abgerufen am 6. November 2013 .
  10. ^ Französisch D (4. August 2006). "ALPSP-Technologie-Update: Ein Standard-XML-Dokumentformat: Der Fall für die Einführung der NLM-DTD" . ALPSP . Abgerufen am 6. November 2013 .
  11. ^ "NCBI Book Tag Set" . dtd.nlm.nih.gov .
  12. ^ "Nachrichten aus der Library of Congress" . Kongressbibliothek . 19. April 2006 . Abgerufen am 6. November 2013 .
  13. ^ "Inera Inc. - NLM DTD-Ressourcen" . 19. Februar 2013. Aus dem Original am 19.02.2013 archiviert.
  14. ^ "Public Access Pläne der US-Bundesbehörden" . cendi.gov .
  15. ^ Kovo Y (22. Juli 2016). "Öffentlicher Zugang zu Ergebnissen der von der NASA finanzierten Forschung" . nasa.gov .
  16. ^ "NASA in PMC" . Vorschau.ncbi.nlm.nih.gov .
  17. ^ NLM Journal Archivierungs- und Austausch-Tag-Suite , Nationales Zentrum für biotechnische Informationen, National Library of Medicine
  18. ^ "PLOS begrüßt Kongress für Maßnahmen zum Open Access" . Archiviert vom Original am 07.05.2016 . Abgerufen am 07.02.2014 .
  19. ^ "ACS-Einreichung beim Amt für Wissenschafts- und Technologiepolitik Anfrage nach Informationen über den Zugang der Öffentlichkeit zu von Experten begutachteten wissenschaftlichen Veröffentlichungen, die sich aus staatlich finanzierter Forschung ergeben" (PDF) . Büro für Wissenschafts- und Technologiepolitik . Abgerufen am 07.02.2014 - über das Nationalarchiv .
  20. ^ Davis PM (Oktober 2012). "Die Auswirkung der öffentlichen Hinterlegung wissenschaftlicher Artikel auf die Leserschaft". Der Physiologe . 55 (5): 161, 163–5. PMID 23155924 . 
  21. ^ Davis PM (Juli 2013). "Die öffentliche Zugänglichkeit von biomedizinischen Artikeln aus PubMed Central verringert die Leserschaft von Zeitschriften - retrospektive Kohortenanalyse" . FASEB Journal . 27 (7): 2536–41. doi : 10.1096 / fj.13-229922 . PMC 3688741 . PMID 23554455 .  
  22. ^ Davis PM (Juli 2013). "Die öffentliche Zugänglichkeit von biomedizinischen Artikeln aus PubMed Central verringert die Leserschaft von Zeitschriften - retrospektive Kohortenanalyse" . FASEB Journal . 27 (7): 2536–41. doi : 10.1096 / fj.13-229922 . PMC 3688741 . PMID 23554455 .  
  23. ^ "Autismus spricht kündigt neue Richtlinie an, um Familien einen einfachen und kostenlosen Zugang zu wichtigen Forschungsergebnissen zu ermöglichen - Pressemitteilung - Autismus spricht" . www.autismspeaks.org . 25. Juli 2012.
  24. ^ Antelman, Kristin (2004). "Haben Open-Access-Artikel einen größeren Einfluss auf die Forschung?" . Hochschul- und Forschungsbibliotheken . 65 (5): 372–382. doi : 10.5860 / crl.65.5.372 ., zusammengefasst von Stemper J, Williams K (2006). "Wissenschaftliche Kommunikation: Krise in Chance verwandeln" . College & Research Libraries Nachrichten . 67 (11): 692–696. doi : 10.5860 / crln.67.11.7720 .
  25. ^ Davis PM, Lewenstein BV, Simon DH, Stand JG, Connolly MJ (Juli 2008). "Open Access Publishing, Artikel-Downloads und Zitate: randomisierte kontrollierte Studie" . BMJ . 337 : a568. doi : 10.1136 / bmj.a568 . PMC 2492576 . PMID 18669565 .  
  26. ^ "Die National Library of Medicine erweitert den Zugang zu Coronavirus-Literatur über PubMed Central" . Nationale Gesundheitsinstitute (NIH) . 2020-03-25 . Abgerufen am 31.03.2020 . Um diese Initiative zu unterstützen, passt NLM seine Standardverfahren für die Hinterlegung von Artikeln in PMC an, um eine größere Flexibilität zu gewährleisten, die sicherstellt, dass die Coronavirus-Forschung leicht verfügbar ist.
  27. ^ "PMCID in Citations | publicaccess.nih.gov einschließen" . publicaccess.nih.gov . Abgerufen am 01.07.2017 .

Externe Links [ Bearbeiten ]

  • Offizielle Website
  • National Institutes of Health Submission System (NIHMS)
  • NIH Public Access Policy