Ontologie (Informationswissenschaft)

Das zusammengesetzte Wort Ontologie verbindet sich mit - , aus dem Griechischen , ν , auf ( gen. Ὄντος, ontos ), dh "Sein; das, was ist", was das gegenwärtige Partizip des Verbs εἰμί , eimí , dh "sein, bin ich ", und -λογία , -logia , dh" logischer Diskurs ", siehe klassische Verbindungen für diese Art der Wortbildung. ^{[2] [3]}

Während die Etymologie griechisch ist, erschien die älteste erhaltene Aufzeichnung des Wortes selbst, die New Latin Form Ontologia , 1606 im Werk Ogdoas Scholastica von Jacob Lorhard ( Lorhardus ) und 1613 im Lexicon philosophicum von Rudolf Göckel ( Goclenius ).

Das erste Auftreten der Ontologie in englischer Sprache, wie es von der OED ( Oxford English Dictionary , Online-Ausgabe, 2008) aufgezeichnet wurde , erfolgte in Archeologia Philosophica Nova oder New Principles of Philosophy von Gideon Harvey .

Was Ontologien sowohl in der Informationswissenschaft als auch in der Philosophie gemeinsam haben, ist der Versuch, Entitäten, Ideen und Ereignisse mit all ihren voneinander abhängigen Eigenschaften und Beziehungen nach einem System von Kategorien darzustellen. In beiden Bereichen gibt es umfangreiche Arbeiten zu Problemen der Ontologie (z. B. Quine und Kripke in der Philosophie, Sowa und Guarino in der Informatik) ^[4] und Debatten darüber, inwieweit normative Ontologie möglich ist (z. B. Fundamentalismus und Kohärenz in) Philosophie, BFO und Cyc in künstlicher Intelligenz). Die angewandte Ontologie wird als spiritueller Nachfolger früherer philosophischer Arbeiten angesehen. Viele aktuelle Bemühungen befassen sich jedoch mehr mit der Erstellung kontrollierter Vokabulare enger Bereiche als mit ersten Prinzipien , der Existenz fester Essenzen oder der Frage, ob dauerhafte Objekte (z. B. Perdurantismus und Endurantismus ) ontologisch sein können primärer als Prozesse .

Jedes Gebiet verwendet ontologische Annahmen, um explizite Theorien, Forschungen und Anwendungen zu formulieren. Zum Beispiel ist die Definition und Ontologie der Wirtschaft ist ein Primat Anliegen in marxistischer Ökonomie , ^[5] , sondern auch in anderen Teilgebieten der Ökonomie . ^[6] Ein Beispiel für eine Wirtschaft, die sich auf die Informationswissenschaft stützt, findet sich in Fällen, in denen eine Simulation oder ein Modell wirtschaftliche Entscheidungen ermöglichen soll, z. B. die Bestimmung, welches Kapitalvermögen wie stark gefährdet ist (siehe Risikomanagement ).

Künstliche Intelligenz hat die größte Aufmerksamkeit in Bezug auf angewandte Ontologie in Teilbereichen wie der Verarbeitung natürlicher Sprache in der maschinellen Übersetzung und der Wissensrepräsentation erhalten , aber Ontologie-Editoren werden häufig in einer Reihe von Bereichen wie Bildung eingesetzt, ohne die Absicht, zur KI beizutragen. ^[7]

Ontologien entstehen aus dem Zweig der Philosophie, der als Metaphysik bekannt ist und sich mit Fragen wie "Was gibt es?" Befasst. und "was ist die Natur der Realität?". Einer von fünf traditionellen Zweigen der Philosophie, die Metaphysik, befasst sich mit der Erforschung der Existenz durch Eigenschaften, Entitäten und Beziehungen, wie jene zwischen Einzelheiten und Universalien , intrinsischen und extrinsischen Eigenschaften oder Essenz und Existenz . Die Metaphysik ist seit der Geschichte ein ständiges Diskussionsthema.

Seit Mitte der 1970er Jahre, Forscher auf dem Gebiet der künstlichen Intelligenz (AI) haben erkannt , dass Knowledge Engineering ist der Schlüssel zum Aufbau großer und leistungsfähigen KI - Systeme ^{[ Bearbeiten ]} . KI-Forscher argumentierten, dass sie neue Ontologien als Rechenmodelle erstellen könnten , die bestimmte Arten des automatisierten Denkens ermöglichen , was nur unwesentlich erfolgreich war . In den 1980er Jahren begann die KI-Community, den Begriff Ontologie sowohl für eine Theorie einer modellierten Welt als auch für eine Komponente wissensbasierter Systeme zu verwenden . Insbesondere führte David Powers das Wort Ontologie in AI ein, um sich auf die reale Welt oder die Erdung von Robotern zu beziehen. ^{[8] [9] [10]} 1990 veröffentlichte er Literaturrecherchen, in denen die geerdete Ontologie im Zusammenhang mit der Aufforderung zur Einreichung von Beiträgen für eine AAAI-Sommersymposium-Maschine hervorgehoben wurde Erlernen der natürlichen Sprache und Ontologie mit einer erweiterten Version, die im SIGART Bulletin veröffentlicht und als Vorwort zum Verfahren beigefügt wurde. ^[11] Einige Forscher, die sich von philosophischen Ontologien inspirieren ließen, betrachteten die rechnergestützte Ontologie als eine Art angewandte Philosophie. ^[12]

1993 verwendete die viel zitierte Webseite und das Papier "Auf dem Weg zu Prinzipien für das Design von Ontologien, die für den Wissensaustausch verwendet werden" von Tom Gruber ^[13] die Ontologie als Fachbegriff in der Informatik, der eng mit der früheren Idee semantischer Netzwerke und Taxonomien verwandt ist . Gruber führte den Begriff als Spezifikation einer Konzeptualisierung ein :

Eine Ontologie ist eine Beschreibung (wie eine formale Spezifikation eines Programms) der Konzepte und Beziehungen, die für einen Agenten oder eine Gemeinschaft von Agenten formal existieren können. Diese Definition steht im Einklang mit der Verwendung der Ontologie als Satz von Konzeptdefinitionen, ist jedoch allgemeiner. Und es ist ein anderer Sinn des Wortes als seine Verwendung in der Philosophie. ^[14]

In dem Versuch, Ontologien von Taxonomien und ähnlichen Bemühungen bei der Wissensmodellierung zu distanzieren , die auf Klassen und Vererbung beruhen , erklärte Gruber (1993):

Ontologien werden häufig mit taxonomischen Hierarchien von Klassen, Klassendefinitionen und der Subsumtionsbeziehung gleichgesetzt , aber Ontologien müssen nicht auf diese Formen beschränkt sein. Ontologien sind auch nicht auf konservative Definitionen beschränkt, dh Definitionen  im traditionellen logischen Sinne, die nur Terminologie einführen und kein Wissen über die Welt hinzufügen. ^[15] Um eine Konzeptualisierung zu spezifizieren, müssen Axiome angegeben werden , die die möglichen Interpretationen für die definierten Begriffe einschränken. ^[16]

Zur Verfeinerung von Grubers Definition stellten Feilmayr und Wöß (2016) fest: "Eine Ontologie ist eine formale, explizite Spezifikation einer gemeinsamen Konzeptualisierung, die sich durch eine hohe semantische Ausdruckskraft auszeichnet, die für eine erhöhte Komplexität erforderlich ist." ^[17]

Zeitgenössische Ontologien weisen viele strukturelle Ähnlichkeiten auf, unabhängig von der Sprache, in der sie ausgedrückt werden. Die meisten Ontologien beschreiben Individuen (Instanzen), Klassen (Konzepte), Attribute und Beziehungen. In diesem Abschnitt wird jede dieser Komponenten der Reihe nach erläutert.

Zu den allgemeinen Komponenten von Ontologien gehören:

Einzelpersonen

Instanzen oder Objekte (die Basis- oder "Boden" -Objekte)

Klassen

Mengen, Sammlungen, Konzepte, Klassen in der Programmierung , Arten von Objekten oder Arten von Dingen

Attribute

Aspekte, Eigenschaften, Merkmale, Eigenschaften oder Parameter, die Objekte (und Klassen) haben können

Beziehungen

Möglichkeiten, wie Klassen und Individuen miteinander in Beziehung gesetzt werden können

Funktionsbegriffe

Komplexe Strukturen aus bestimmten Beziehungen, die anstelle eines einzelnen Begriffs in einer Aussage verwendet werden können

Beschränkungen

Formell festgelegte Beschreibungen dessen, was wahr sein muss, damit eine Behauptung als Eingabe akzeptiert wird

Regeln

Aussagen in Form eines Wenn-Dann-Satzes (Antezedenz-Konsequenz), die die logischen Schlussfolgerungen beschreiben, die aus einer Behauptung in einer bestimmten Form gezogen werden können

Axiome

Behauptungen (einschließlich Regeln) in logischer Form , die zusammen die Gesamttheorie bilden, die die Ontologie in ihrem Anwendungsbereich beschreibt. Diese Definition unterscheidet sich von der der "Axiome" in der generativen Grammatik und der formalen Logik . In diesen Disziplinen umfassen Axiome nur Aussagen, die als a priori Wissen geltend gemacht werden . Wie hier verwendet, umfassen "Axiome" auch die Theorie, die aus axiomatischen Aussagen abgeleitet ist

Veranstaltungen

Das Ändern von Attributen oder Beziehungen

Ontologien werden üblicherweise in Ontologiesprachen codiert .

Domain-Ontologie

Eine Domänenontologie (oder domänenspezifische Ontologie) repräsentiert Konzepte, die zu einem Bereich der Welt gehören, wie z. B. Biologie oder Politik. Jede Domänenontologie modelliert normalerweise domänenspezifische Definitionen von Begriffen. Zum Beispiel hat die Wortkarte viele verschiedene Bedeutungen. Eine Ontologie über die Domäne des Pokers würde die Bedeutung des Wortes " Spielkarte " modellieren , während eine Ontologie über die Domäne der Computerhardware die Bedeutungen " Lochkarte " und " Grafikkarte " modellieren würde .

Da Domain-Ontologien von verschiedenen Personen geschrieben werden, stellen sie Konzepte auf sehr spezifische und einzigartige Weise dar und sind häufig innerhalb desselben Projekts nicht kompatibel. Wenn Systeme, die auf Domänenontologien basieren, erweitert werden, müssen sie häufig Domänenontologien zusammenführen, indem sie jede Entität von Hand optimieren oder eine Kombination aus Software-Zusammenführung und Hand-Optimierung verwenden. Dies ist eine Herausforderung für den Ontologiedesigner. Unterschiedliche Ontologien in derselben Domäne entstehen aufgrund unterschiedlicher Sprachen, unterschiedlicher Verwendungszwecke der Ontologien und unterschiedlicher Wahrnehmungen der Domäne (basierend auf kulturellem Hintergrund, Bildung, Ideologie usw.) ^{[ Zitieren erforderlich ]} .

Gegenwärtig ist das Zusammenführen von Ontologien, die nicht aus einer gemeinsamen oberen Ontologie entwickelt wurden, ein weitgehend manueller Prozess und daher zeitaufwändig und teuer. Domänenontologien, die dieselbe obere Ontologie verwenden, um eine Reihe grundlegender Elemente bereitzustellen, mit denen die Bedeutungen der Domänenontologieentitäten angegeben werden können, können mit weniger Aufwand zusammengeführt werden. Es gibt Studien zu verallgemeinerten Techniken zum Zusammenführen von Ontologien ^[18], aber dieser Forschungsbereich ist noch nicht abgeschlossen, und es ist eine aktuelle Veranstaltung, bei der das Problem umgangen wird, indem mehrere Domain-Ontologien verwendet werden, die dieselbe obere Ontologie wie die OBO-Gießerei verwenden .

Obere Ontologie

Eine obere Ontologie (oder Foundation-Ontologie) ist ein Modell der gemeinsam genutzten Beziehungen und Objekte, die allgemein für eine Vielzahl von Domänenontologien anwendbar sind. In der Regel wird ein Kernglossar verwendet , das die Begriffe und zugehörigen Objektbeschreibungen überlagert, wie sie in verschiedenen relevanten Domänenontologien verwendet werden.

Zu den standardisierten oberen Ontologien, die zur Verwendung verfügbar sind , gehören BFO , BORO-Methode , Dublin Core , GFO , Cyc , SUMO , UMBEL , die Unified Foundational Ontology (UFO) ^[19] und DOLCE . ^{[20] [21]} WordNet wurde von einigen als obere Ontologie angesehen und als sprachliches Werkzeug zum Lernen von Domänenontologien verwendet. ^[22]

Hybride Ontologie

Die Gellish- Ontologie ist ein Beispiel für eine Kombination aus einer oberen und einer Domänen-Ontologie.

Eine Übersicht über Methoden zur Ontologievisualisierung wird von Katifori et al. ^[23] Eine aktualisierte Übersicht über Methoden und Werkzeuge zur Ontologievisualisierung wurde von Dudás et al. ^[24] Die etabliertesten Methoden zur Ontologievisualisierung, nämlich die Visualisierung von eingerückten Bäumen und Graphen, werden von Fu et al. ^[25] Eine visuelle Sprache für in OWL dargestellte Ontologien wird in der visuellen Notation für OWL-Ontologien (VOWL) ​​angegeben . ^[26]

Ontologie-Engineering (auch als Ontologie-Erstellung bezeichnet) ist eine Reihe von Aufgaben im Zusammenhang mit der Entwicklung von Ontologien für eine bestimmte Domäne. ^[27] Es ist ein Teilgebiet des Knowledge Engineering , das den Entwicklungsprozess der Ontologie, den Lebenszyklus der Ontologie, die Methoden und Methoden zum Erstellen von Ontologien sowie die Werkzeuge und Sprachen, die sie unterstützen, untersucht. ^{[28] [29]}

Das Ontologie-Engineering zielt darauf ab, das in Softwareanwendungen und organisatorischen Verfahren für eine bestimmte Domäne enthaltene Wissen explizit zu machen. Das Ontologie-Engineering bietet eine Anleitung zur Überwindung semantischer Hindernisse, z. B. im Zusammenhang mit der Definition von Geschäftsbegriffen und Softwareklassen. Bekannte Herausforderungen beim Ontologie-Engineering sind:

1. Die Ontologie Die Gewährleistung ist aktuell mit Domänenwissen und Zeitanwendung
2. Bereitstellung einer ausreichenden Spezifität und Konzeptabdeckung für den interessierenden Bereich, wodurch das Problem der Vollständigkeit des Inhalts minimiert wird
3. Sicherstellen, dass die Ontologie ihre Anwendungsfälle unterstützen kann

Redakteure

Ontologie-Editoren sind Anwendungen, die bei der Erstellung oder Bearbeitung von Ontologien helfen sollen. Es ist üblich, dass Ontologie-Editoren eine oder mehrere Ontologiesprachen verwenden .

Zu den Aspekten der Ontologie-Editoren gehören: visuelle Navigationsmöglichkeiten innerhalb des Wissensmodells , Inferenz-Engines und Informationsextraktion ; Unterstützung für Module; den Import und Export von Fremdsprachen zur Darstellung von Wissen für den Ontologie-Abgleich ; und die Unterstützung von Meta-Ontologien wie OWL-S , Dublin Core usw. ^[30]

Lernen

Das Lernen von Ontologien ist die automatische oder halbautomatische Erstellung von Ontologien, einschließlich des Extrahierens der Begriffe einer Domäne aus Text in natürlicher Sprache. Da das manuelle Erstellen von Ontologien äußerst arbeitsintensiv und zeitaufwändig ist, besteht eine große Motivation, den Prozess zu automatisieren. Informationsextraktion und Text Mining wurden untersucht, um Ontologien automatisch mit Dokumenten zu verknüpfen, beispielsweise im Kontext der BioCreative-Herausforderungen. ^[31]

Eine Ontologiesprache ist eine formale Sprache, die zum Codieren einer Ontologie verwendet wird. Es gibt eine Reihe solcher Sprachen für Ontologien, sowohl proprietäre als auch standardbasierte:

• Common Algebraic Specification Language ist eine allgemeine logikbasierte Spezifikationssprache, die in der IFIP-Arbeitsgruppe 1.3 "Grundlagen von Systemspezifikationen" entwickelt wurde und de facto eine Standardsprache für Softwarespezifikationen ist. Es wird jetzt auf Ontologiespezifikationen angewendet, um Modularität und Strukturierungsmechanismen bereitzustellen.
• Gemeinsame Logik ist der ISO-Standard 24707, eine Spezifikation einer Familie von Ontologiesprachen, die genau ineinander übersetzt werden können.
• Das Cyc- Projekt verfügt über eine eigene Ontologiesprache namens CycL , die auf Prädikatenkalkül erster Ordnung mit einigen Erweiterungen höherer Ordnung basiert .
• DOGMA (Developing Ontology-Grounded Methods and Applications) verwendet den faktenorientierten Modellierungsansatz, um ein höheres Maß an semantischer Stabilität bereitzustellen.
• Die Gellish- Sprache enthält Regeln für ihre eigene Erweiterung und integriert somit eine Ontologie in eine Ontologiesprache.
• IDEF5 ist eine Software-Engineering- Methode zur Entwicklung und Pflege verwendbarer, genauer Domain-Ontologien.
• KIF ist eine Syntax für Logik erster Ordnung , die auf S-Ausdrücken basiert . SUO-KIF ist eine abgeleitete Version, die die vorgeschlagene obere zusammengeführte Ontologie unterstützt .
• MOF und UML sind Standards der OMG
• Olog ist ein kategorietheoretischer Ansatz für Ontologien, bei dem Übersetzungen zwischen Ontologien mithilfe von Funktoren im Vordergrund stehen .
• OBO , eine Sprache für biologische und biomedizinische Ontologien.
• OntoUML ist ein ontologisch fundiertes Profil von UML zur konzeptionellen Modellierung von Domain-Ontologien.
• OWL ist eine Sprache für ontologische Aussagen, die als Folge von RDF und RDFS sowie früheren Ontologie-Sprachprojekten wie OIL , DAML und DAML + OIL entwickelt wurde . OWL soll über das World Wide Web verwendet werden , und alle seine Elemente (Klassen, Eigenschaften und Einzelpersonen) werden als RDF- Ressourcen definiert und durch URIs identifiziert .
• RIF ( Rule Interchange Format ) und F-Logic kombinieren Ontologien und Regeln.
• Die Semantic Application Design Language (SADL) ^[32] erfasst eine Teilmenge der Ausdruckskraft von OWL mithilfe einer englischsprachigen Sprache, die über ein Eclipse- Plug-in eingegeben wird .
• SBVR (Semantics of Business Vocabularies and Rules) ist ein OMG-Standard, der in der Industrie zum Aufbau von Ontologien angewendet wird.
• TOVE-Projekt , TOronto Virtual Enterprise-Projekt

• Arabische Ontologie , eine sprachliche Ontologie für Arabisch, die als arabisches Wordnet verwendet werden kann, aber einen ontologisch sauberen Inhalt hat.
• AURUM - Informationssicherheits-Ontologie, ^[33] Eine Ontologie für den Wissensaustausch zur Informationssicherheit, mit der Benutzer den Wissensbestand der Domäne gemeinsam verstehen und erweitern können. Es kann als Grundlage für ein automatisiertes Informationssicherheitsrisiko- und Compliance-Management dienen.
• BabelNet , ein sehr großes mehrsprachiges semantisches Netzwerk und eine Ontologie, die in vielen Sprachen lexikalisiert sind
• Grundlegende formale Ontologie, ^[34] eine formale obere Ontologie zur Unterstützung der wissenschaftlichen Forschung
• BioPAX, ^[35] eine Ontologie zum Austausch und zur Interoperabilität von Daten über biologische Signalwege (zelluläre Prozesse)
• BMO, ^[36] eine E-Business-Modell-Ontologie, die auf einer Überprüfung von Unternehmens-Ontologien und Geschäftsmodellliteratur basiert
• SSBMO, ^[37] eine stark nachhaltige Geschäftsmodell-Ontologie, die auf einer Überprüfung der systembasierten natur- und sozialwissenschaftlichen Literatur (einschließlich der Wirtschaft) basiert. Beinhaltet Kritik und signifikante Erweiterungen der Business Model Ontology (BMO).
• CCO und GexKB, ^[38] Application Ontologies (APO), die verschiedene Arten von Wissen in die Cell Cycle Ontology (CCO) und die Gene Expression Knowledge Base (GexKB) integrieren
• CContology (Customer Complaint Ontology), ^[39] eine E-Business-Ontologie zur Unterstützung des Online-Managements von Kundenbeschwerden
• CIDOC Conceptual Reference Model , eine Ontologie für das kulturelle Erbe ^[40]
• COSMO, ^[41] eine Foundation Ontology (aktuelle Version in OWL), die Darstellungen aller primitiven Konzepte enthält, die zur logischen Angabe der Bedeutungen einer Domänenentität erforderlich sind. Es soll als grundlegende Ontologie dienen, die zum Übersetzen zwischen den Darstellungen in anderen Ontologien oder Datenbanken verwendet werden kann. Es begann als Zusammenführung der Grundelemente der OpenCyc- und SUMO-Ontologien und wurde durch andere Ontologieelemente (Typen, Beziehungen) ergänzt, um Darstellungen aller Wörter im Longman-Wörterbuch aufzunehmen , die den Wortschatz definieren .
• Computer Science Ontology , eine automatisch generierte Ontologie von Forschungsthemen im Bereich der Informatik
• Cyc , eine große Foundation Ontology zur formalen Darstellung des Diskursuniversums
• Disease Ontology , ^[42] zur Erleichterung der Zuordnung von Krankheiten und damit verbundenen Zuständen zu bestimmten medizinischen Codes
• DOLCE , eine deskriptive Ontologie für Linguistic and Cognitive Engineering ^{[20] [21]}
• Drammar, Ontologie des Dramas ^{[43] [ Zitieren erforderlich ]}
• Dublin Core , eine einfache Ontologie für Dokumente und Veröffentlichungen
• Financial Industry Business Ontology (FIBO), eine geschäftskonzeptuelle Ontologie für die Finanzindustrie ^[44]
• Grundlegende, zentrale und sprachliche Ontologien ^[45]
• Grundmodell der Anatomie , ^[46] eine Ontologie für die menschliche Anatomie
• Freund eines Freundes , eine Ontologie zur Beschreibung von Personen, ihrer Aktivitäten und ihrer Beziehungen zu anderen Personen und Gegenständen
• Gen-Ontologie für die Genomik
• Gellish English Dictionary , eine Ontologie, die ein Wörterbuch und eine Taxonomie enthält, die eine obere Ontologie und eine untere Ontologie umfasst, die sich auf industrielle und geschäftliche Anwendungen in den Bereichen Ingenieurwesen, Technologie und Beschaffung konzentrieren.
• Geopolitische Ontologie , eine Ontologie, die geopolitische Informationen beschreibt, die von der Ernährungs- und Landwirtschaftsorganisation (FAO) erstellt wurden. Die geopolitische Ontologie umfasst Namen in mehreren Sprachen (Englisch, Französisch, Spanisch, Arabisch, Chinesisch, Russisch und Italienisch); kartiert Standardcodierungssysteme (UN, ISO, FAOSTAT, AGROVOC usw.); bietet Beziehungen zwischen Gebieten (Landgrenzen, Gruppenmitgliedschaft usw.); und verfolgt historische Veränderungen. Darüber hinaus bietet die FAO Webdienste für geopolitische Ontologie und einen Modulhersteller an, um Module der geopolitischen Ontologie in verschiedene Formate (RDF, XML und EXCEL) herunterzuladen. Weitere Informationen finden Sie unter FAO-Länderprofile .
• GAO (General Automotive Ontology) - eine Ontologie für die Automobilindustrie, die "Auto" -Erweiterungen umfasst ^[47]
• GOLD, ^[48] Allgemeine Ontologie für die sprachliche Beschreibung
• GUM (Generalized Upper Model), ^[49] eine sprachlich motivierte Ontologie zur Vermittlung zwischen Client-Systemen und natürlicher Sprachtechnologie
• IDEAS Group , ^[50] eine formale Ontologie für Unternehmensarchitektur, die vom australischen, kanadischen, britischen und US-amerikanischen Verteidigungsministerium entwickelt wird.
• Linkbase, ^[51] eine formale Darstellung der biomedizinischen Domäne, basierend auf Basic Formal Ontology.
• LPL, Landmark Pattern Language ^[52]
• NCBO Bioportal, ^[53] biologische und biomedizinische Ontologien und zugehörige Tools zum Suchen, Durchsuchen und Visualisieren
• NIFSTD- Ontologien aus dem Neuroscience Information Framework : Ein modularer Satz von Ontologien für den Bereich der Neurowissenschaften.
• OBO-Edit, ^[54] ein Ontologie-Browser für die meisten offenen biologischen und biomedizinischen Ontologien
• OBO Foundry , ^[55] eine Reihe interoperabler Referenzontologien in Biologie und Biomedizin
• OMNIBUS Ontology, ^[56] eine Ontologie des Lernens, des Unterrichts und des Unterrichtsdesigns
• Ontologie für biomedizinische Untersuchungen , eine offene, integrierte Ontologie für biologische und klinische Untersuchungen
• ONSTR, ^[57] Ontologie für Neugeborenen-Screening-Follow-up und translationale Forschung, Neugeborenen-Screening-Follow-up-Datenintegrationskollaborative, Emory University, Atlanta.
• Pflanzenontologie ^[58] für Pflanzenstrukturen und Wachstums- / Entwicklungsstadien usw.
• PAPST, Purdue Ontology for Pharmaceutical Engineering
• PRO, ^[59] die Proteinontologie der Proteininformationsressource, Georgetown University
• ProbOnto , Wissensbasis und Ontologie von Wahrscheinlichkeitsverteilungen . ^{[60] [61]}
• Programmabstraktionstaxonomie ^{[ Zitieren erforderlich ]}
• Protein-Ontologie ^[62] für die Proteomik
• RXNO Ontology , für Namensreaktionen in der Chemie
• Sequence Ontology , ^[63] zur Darstellung genomischer Merkmalstypen, die in biologischen Sequenzen gefunden wurden
• SNOMED CT (Systematisierte Nomenklatur der Medizin - klinische Begriffe)
• Vorgeschlagene obere zusammengeführte Ontologie , eine formale obere Ontologie
• Systembiologische Ontologie (SBO) für Rechenmodelle in der Biologie
• SWEET, ^[64] Semantic Web für Erd- und Umweltterminologie
• ThoughtTreasure Ontologie
• ZEITPUNKT , Themen zur Indexierung der medizinischen Ausbildung
• Uberon , ^[65] repräsentiert Tier anatomische Strukturen
• UMBEL , eine einfache Referenzstruktur aus 20.000 Fachkonzeptklassen und deren Beziehungen, die von OpenCyc abgeleitet wurden
• WordNet , ein lexikalisches Referenzsystem
• YAMATO, ^[66] Noch eine fortgeschrittenere Top-Level-Ontologie

Das W3C Linking Open Data-Community-Projekt koordiniert Versuche, verschiedene Ontologien im weltweiten Semantic Web zusammenzuführen .

Die Entwicklung von Ontologien hat zur Entstehung von Diensten geführt, die Listen oder Verzeichnisse von Ontologien bereitstellen, die als Ontologiebibliotheken bezeichnet werden.

Das Folgende sind Bibliotheken von vom Menschen ausgewählten Ontologien.

• COLORE ^[67] ist ein offenes Repository für Ontologien erster Ordnung in Common Logic mit formalen Verknüpfungen zwischen Ontologien im Repository.
• Die DAML Ontology Library ^[68] verwaltet ein Vermächtnis von Ontologien in DAML.
• Das Ontology Design Patterns-Portal ^[69] ist ein Wiki-Repository mit wiederverwendbaren Komponenten und Praktiken für das Ontologie-Design und enthält eine Liste beispielhafter Ontologien .
• Die Protégé Ontology Library ^[70] enthält eine Reihe von OWL-, Frame-basierten und anderen Format-Ontologien.
• SchemaWeb ^[71] ist ein Verzeichnis von RDF-Schemata, ausgedrückt in RDFS, OWL und DAML + OIL.

Das Folgende sind sowohl Verzeichnisse als auch Suchmaschinen.

• OBO Foundry ist eine Reihe interoperabler Referenzontologien in der Biologie und Biomedizin. ^{[72] [73]}
• Bioportal (Ontologie-Repository von NCBO) ^[74]
• OntoSelect ^{[75] Die} Ontologiebibliothek bietet ähnliche Dienste für RDF / S-, DAML- und OWL-Ontologien.
• Ontaria ^[76] ist ein "durchsuchbares und durchsuchbares Verzeichnis semantischer Webdaten" mit Schwerpunkt auf RDF-Vokabularen mit OWL-Ontologien. (NB Projekt "in der Warteschleife" seit 2004).
• Swoogle ist ein Verzeichnis und eine Suchmaschine für alle im Web verfügbaren RDF-Ressourcen, einschließlich Ontologien.
• Open Ontology Repository Initiative ^[77]
• ROMULUS ist ein grundlegendes Ontologie-Repository zur Verbesserung der semantischen Interoperabilität. Derzeit befinden sich drei grundlegende Ontologien im Repository: DOLCE , BFO und GFO . ^{[ Zitat benötigt ]}

Im Allgemeinen können Ontologien in mehreren Bereichen vorteilhaft eingesetzt werden.

• Geschäftliche Anwendungen. ^[78] Ein konkretes Beispiel ist SAPPHIRE (Gesundheitswesen) oder Situational Awareness und Bereitschafts für Public Health Incidences und Reasoning Engines , die eine ist Semantik basierende Gesundheitsinformationssystem der Lage , Verfolgung und Auswertung von Situationen und Ereignisse , die beeinflussen können , die öffentliche Gesundheit .
• Geografische Informationssysteme bringen Daten aus verschiedenen Quellen zusammen und profitieren daher von ontologischen Metadaten, die dazu beitragen, die Semantik der Daten zu verbinden. ^[79]
• Domänenspezifische Ontologien sind in der biomedizinischen Forschung äußerst wichtig. Dies erfordert die Disambiguierung verschiedener biomedizinischer Begriffe und Abkürzungen durch benannte Entitäten, die dieselbe Zeichenfolge aufweisen, jedoch unterschiedliche biomedizinische Konzepte darstellen. Zum Beispiel kann CSF den koloniestimulierenden Faktor oder die zerebrale Wirbelsäulenflüssigkeit darstellen, die beide in der biomedizinischen Literatur durch denselben Begriff CSF dargestellt werden. ^{[80] Aus} diesem Grund beziehen sich zahlreiche öffentliche Ontologien auf die Biowissenschaften. Life-Science-Data-Science-Tools, die diese Art von biomedizinischen Ontologien nicht implementieren, können die kausalen Beziehungen zwischen Konzepten nicht genau bestimmen. ^[81]

Verwandte philosophische Konzepte

• Alphabet des menschlichen Denkens
• Characteristica universalis
• Interoperabilität
• Metasprache
• Natürliche semantische Metasprache

• Oberle, D., Guarino, N. & Staab, S. (2009) Was ist eine Ontologie? . ( pdf ) In: "Handbuch zu Ontologien". Springer, 2. Auflage, 2009.
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• Maria Golemati, Akrivi Katifori, Costas Vassilakis, George Lepouras, Constantin Halatsis (2007). "Erstellen einer Ontologie für das Benutzerprofil: Methode und Anwendungen" . In: Vorträge der ersten internationalen IEEE-Konferenz zu Forschungsherausforderungen in der Informationswissenschaft (RCIS) , Marokko 2007.
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• Wissensrepräsentation bei Open Directory Project
• Bibliothek von Ontologien
• GoPubMed verwendet Ontologien für die Suche
• ONTOLOG (auch bekannt als " Ontolog Forum ") - eine offene, internationale, virtuelle Community of Practice für Ontologie, Ontologietechnik und semantische Technologie
• Verwendung von Ontologien in der Verarbeitung natürlicher Sprache
• Ontologie-Gipfel - eine jährliche Veranstaltungsreihe (erstmals 2006 gestartet), an der die Ontologie-Community und die Communitys beteiligt sind, die sich auf das für den Gipfel ausgewählte Thema jedes Jahres beziehen.
• Standardisierung von Ontologien